Le Comité gère l'administration et les finances de l'AFMEC. Les 9 personnes qui le composent représentent les différentes régions du canton de Fribourg et les diverses sensibilités professionnelles des métiers de menuisiers, ébénistes et charpentiers.

L'AFMEC s'implique dans de nombreuses commissions, associations et organes paritaires dans le canton et en Suisse romande.